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明世宗嘉靖时期，营政废坏如故，京营兵士仅余5 万余人，加派文臣提
督团营。嘉靖十五年，都御史王廷相受命提督团营，他对当时营务的看法，
颇为中肯：一是军士多被朝廷及中贵、武臣拉去服工役，不似武夫，倒与田
夫无异。二是到了年龄的兵士，应由子弟替代，但吏胥上下其手，索要重贿，
使贫困老弱兵士充斥营伍。三是富裕的兵士不愿参加营操训练，贿赂将领将
名籍列入老家。语虽切中要害，但不久朝廷两郊九庙诸宫殿大兴土木，京营
尽被趋往劳作。嘉靖中期，边警频仍，仅选出骑兵 3 万，仍分作东西官厅，
进行操练。嘉靖二十九年，庚戌之变，鞑靼军兵临北京城下，京营军士仅五
六万人，被驱出城迎战， “皆流涕不敢前，诸将领亦相顾变色”（《明史》
卷九十 《兵志》）。大学士严嵩为塞责，对团营制又进行了改革。
这次改革是罢团营、两官厅，复三大营旧制。三千营改名神枢营。设大
将 1人，称总督京营戎政，设文臣 1人，称协理京营戒政。五军营副将2 人，
参将4 人，游击将军4 人。神枢、神机副将2 人，佐击将军6 人。不久又增
能战之将，称练勇参将6 人，革去神枢、神机副将 1人。12营、两厅、司掖
哨等均罢设。又派遣御史4 人，募兵于畿辅、山东、山西、河南，得 4 万人，
分隶于神枢、神机营，大将所统三营之兵，平日称练勇，有战事时更定职名。
五军营，设大将 1人，统兵 1万，总管三营副、参、游击、佐击及坐营等官；
副将2 员，各统军7000；左右前后参将4 员，各统兵6000；游击4 员，各统
兵3000。外备兵66660 人。神枢营，副将2 员，各统军6000；佐击6 员，各
统兵 3000。外备兵4 万人。神枢营亦同。在京各卫军，俱分隶于三大营。
隆庆年间，一些官员认为三营几十万大军统于一人之手，不符合明太祖、
太宗时分府分营以分权的本意，于是三大营互不统属，各设总兵一员 （又改
称提督），又增设文臣总兵三人，自六提督设后，遇事各持己见，纷争不决，
只得罢设，仍置总督，协理二臣。
此后，营制变化不大，官员设置上有增损而已。崇祯年间，营务已尽领
于中官。出战时，廪给优厚，挟势凌虐将士，瓦解军心。明末，营将尽为内
监私人，不懂军事，营兵只是注名支粮，买人雇役，朝甲暮乙。崇祯帝屡次
要求严加训练，但每日操练者不过二三百人，未到黄昏，人已散去。崇祯问
协理京营戎政的兵部侍郎王家彦，如何才能振刷营务，王家彦称 “势已晚”
（《明史》卷九十《兵志》）。崇祯十八年（1644年）李自成率起义军进攻
北京城，至沙河，京军出战，未及接战，闻炮声已溃不成军，起义军长驱直
入，守城的京军仅有3000 人，城陷，明朝灭亡。
京营并不直接掌管皇帝的宿卫，另专设 12卫为皇帝亲军，不隶于五军都
督府。